Infrastruktura

W projekcie planowana jest przede wszystkim rozbudowa infrastruktury do sekwencjonowania genomów. Już przystępując do realizacji projektu partnerzy dysponowali sporymi zasobami w tym zakresie. Aparatura znajdująca się w posiadaniu konsorcjum G4PL to m. in.:

Sekwenatory do krótkich odczytów (platforma Illumina):

  • NovaSeq X Plus (2 szt.)
  • NovaSeq 6000 (6 szt.)
  • NextSeq 2000 (2 szt.)
  • NextSeq 550 (4 szt.)
  • MiSeq (5 szt.)
  • MiniSeq (2 szt.)

Sekwenatory do długich odczytów:

Platforma Pac-Bio:
  • Sequel IIe (1 szt.)
Platforma Oxford Nanopore:
  • PromethION (1 szt.)
  • GridION (2 szt.)

Aparatura do analiz pojedynczych komórek:

Platforma 10X Genomics:
  • Chromium X (2 szt.)
  • Visium CytAssist (1 szt.)
  • Xenium (1 szt.)
Platforma Tapestri:
  • Tapestri Single-cell Multiomics Platform (Mission Bio, 1 szt.)
Aparatura pomocnicza:
  • Automatyczne stacje pipetujące
(różni producenci, 8 szt)
  • TapeStation (Agilent, 4 szt.)
  • Bioanalyzer 2100 (Agilent, 6 szt.)
  • Sonikatory (Covaris 3 szt, Bioruptor 2 szt)