G4PL – Genomika dla Polski
Kick-off meeting:
- 22 January 2026
- Institute of Bioorganic Chemistry
ul. Wieniawskiego 17/19 POZNAŃ
Kick-off meeting:
- 23 January 2026
- Poznańskie Centrum Superkomputerowo-Sieciowe
ul. Jana Pawła II 10, POZNAŃ
PROGRAMME
22 January 2026
OPEN SESSION
(in English), Aula IBCH PAS
Chair – Dr Małgorzata Marcinkowska-Swojak
The open part of the event on 22 January 2026 will be broadcast and recorded from 9:00 a.m to 11:30 a.m. Participation in the kick-off meeting of the G4PL - Genomics for Poland is tantamount to consenting to the recording and subsequent sharing of the recordings on the social media platforms of the Institute of Bioorganic Chemistry Polish Academy of Sciences, and the Poznańskiego Centrum Superkomputerowo-Sieciowego (e.g. YouTube, Facebook, LinkedIn, Instagram, and X) as well as on the IBCH PAS and PCSS websites.
9:00 – Welcome and introduction – Dr. hab. Luiza Handschuh, prof. IBCH PAS
9:15 – Speeches by Invited Guests
9:30 – Genome of Europe (GoE) project– building a pan-European reference database – Prof. André Uitterlinden, Laboratory for Population Genomics, Erasmus Medical Center, Rotterdam
10:15 – Genetic basis of cancer - results of long-term studies of the Polish population – Prof. Jan Lubiński, Department of Genetics and Pathomorphology, Pomeranian Medical University in Szczecin
11:00 – Genomics for Poland (G4PL) – project presentation – Dr. hab. Luiza Handschuh, prof. IBCH PAS
11:30 – Coffee break
12:00 – The beginnings of genomics and archaeogenomics in Poland – Prof. Marek Figlerowicz, IBCH PAS
12:30 – Mitochondrial genome variation in the contemporary Polish population – Dr. Ireneusz Stolarek, IBCH PAS
13:00 – From population genomics to family history: the Y chromosome in genetic genealogy – Dr. Michał Golubiński, IBCH PAS
13:30 – The miRNome project – results and perspectives – Dr. Paulina Gałka-Marciniak, IBCH PAS
14:00 – Business partner presentations – ANALITYK GENETYKA
14:30 – Lunch
CLOSED SESSION
(in Polish, for project participants only), Aula IBCH PAS
Chair – Dr Małgorzata Marcinkowska-Swojak
15:30 – Short presentations of participants
Photo – in the main hall
16:30 – Finances and organizational issues– general remarks – Marcelina Wysocka/Paulina Szadkowska/Dr Małgorzata Marcinkowska-Swojak
23 January 2026
SESJA ZAMKNIĘTA
(tylko dla konsorcjantów)
siedziba Poznańskiego Centrum Superkomputerowo-Sieciowego (PCSS), ul. Jana Pawła II 10
09:00 – 13:00 – Warsztaty w grupach
Kwestie merytoryczne – Sala 0.26
Kwestie formalne – Sala 0.31
Kwestie merytoryczne – Sala 0.26
09:00 – 10:30 – WP1 – Infrastruktura do sekwencjonowania genomów – Małgorzata Marcinkowska-Swojak
WP1
- Przedstawienie pakietu
- Rola jednostek
- Plan działania
- Grupy robocze
- Pytania/dyskusja
Kwestie formalne – Sala 0.31
09:00 – 09:30 – Finance – Tomasz Kulpa
09:30 – 10:00 – Zamówienia – Katarzyna Wielentejczyk
10:00 – 10:30 – Raportowanie – Marcelina Wysocka, Paulina Szadkowska
Kwestie merytoryczne – Sala 0.26
10:30 – 11:00 – WP2 – Infrastruktura do biobankowania – Błażej Marciniak
WP2
- Przedstawienie pakietu
- Rola jednostek
- Plan działania
- Grupy robocze
- Pytania/Dyskusja
Kwestie formalne – Sala 0.31
10:30 – 11:00 – Promocja (wymogi formalne) – Marcelina Wysocka, Paulina Szadkowska
11:00 – 11:15 – Przerwa
Kwestie merytoryczne – Sala 0.26
11:15 – 12:00 – WP3 – Infrastruktura do analizy danych – Aleksandra Świercz, Paweł Wojciechowski
WP3
- Przedstawienie pakietu
- Rola jednostek
- Plan działania
- Grupy robocze
- Pytania/Dyskusja
Kwestie formalne – Sala 0.31
11:15 – 12:00 – Akredytacja (normy ISO) – Katarzyna Solka
Kwestie merytoryczne – Sala 0.26
12:00 – 12:30 – WP4 – Infrastructure for data storage and sharing – Tomasz Kuczyński
WP4
- Przedstawienie pakietu
- Rola jednostek
- Plan działania
- Grupy robocze
- Pytania/Dyskusja
Kwestie formalne – Sala 0.31
12:00 – 12:30 – Sieć laboratoriów (kwestie organizacyjne) – Agnieszka Konrad
12:30 – 13:00 – Podsumowanie (Sala 0.26) – Dr. hab. Luiza Handschuh, prof. IBCH PAS
13:00– 14:00 – Lunch
14:00 – 15:00 – Zwiedzanie PCSS
Propozycja grup roboczych
WP1 - Infrastruktura do sekwencjonowania genomów
WG 1.1. PRÓBKI / SAMPLES
Wniosek do Komisji Bioetycznej
Ankieta i informacja dla Uczestników
Zakres zgody Uczestników
Wzór raportu
Wybór materiału
Pobieranie materiału
WG 1.2. TECHNOLOGIE SEKWECJONOWANIA / SEQUENCING TECHNOLOGIES
Technologie: Illumina, PacBio, Oxfrod Nanopore, Mapowanie optyczne
Stan aparatury na dziś i za rok
Protokoły przygotowania materiału
Protokoły przygotowania bibliotek
Protokoły sekwencjonowania
WP2 – Infrastruktura do biobankowania
WG 2.1. ZAPLECZE BIOBANKOWANIA
Zaplecze do dyspozycji
Sposób bankowania
Nadzór
WP3 - Infrastruktura do analizy danych
WG 3.1. POTOKI ANALIZY / PIPELINES
WG 3.2. PROGRAM DO ANALIZY I KATEGORYZACJI WARIANTÓW / VARIANT CALLING AND CATEGORIZATION SOFTWARE
WG 3.3. REANALIZA DANYCH / DATA REANALYSIS
WG 3.4. WYKORZYSTANIE KOMPUTERA KWANTOWEGO / APPLICATION OF QUANTUM COMPUTER
WP4 - Infrastruktura do przechowywania i udostępniania danych
WG 4.1. ZAPLECZE REPOZYTORIUM
Poza pakietami:
WG 5 FINANSE
WG 6 ZAMÓWIENIA
WG 7 RAPORTOWANIE
WG 8 PROMOCJA
WG 9 PRAWO I ETYKA
WG 10 AKREDYTACJA LABORATORIÓW – normy ISO
Consortium – G4PL
Leaders:
Partners:
The primary objective of the project is to establish a nationwide network of laboratories conducting research and providing services in the field of genomics, serving academic commercial and healthcare institutions. These activities will support the development of science, personalized medicine, precise diagnostics, innovative therapies, and targeted prevention.
The network will be equipped with advanced infrastructure for genome research, including high-throughput long-read sequencing machines and a device for creating optical maps. The project will also result in the collection of new genomes, including those from patients with rare diseases, the integration and re-analysis of existing data, and their sharing within a nationwide repository. New IT tools for genome analysis will also be developed, utilizing artificial intelligence algorithms and quantum technologies.
Population genomic research contributes to a deeper understanding of genetic variation, disease prevalence, and predisposition, enabling improved diagnostics, personalized treatment, and more effective preventive measures. It also translates into tangible economic benefits, as well-targeted prevention, precise diagnostics, and personalized therapy reduce healthcare costs. The project plans to sequence samples from 6,000-7,000 donors. Some of these samples will constitute Poland’s contribution to the Genome of Europe (GoE) project.